Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HSF4
Ідентифікатори
Символи
HSF4 , CTM, CTRCT5, heat shock transcription factor 4
Зовнішні ІД
OMIM : 602438 MGI: 1347058 HomoloGene: 100128 GeneCards: HSF4
Пов'язані генетичні захворювання
cataract 5 multiple types [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein phosphatase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • nuclear speck
Біологічний процес
• розвиток ока • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • розвиток клітин • histone H3-K9 demethylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • protein homotrimerization • positive regulation of cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • camera-type eye development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein homooligomerization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • зір • cellular response to heat • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 67.16 – 67.17 Mb
Хр. 8: 106 – 106 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
HSF4 (англ. Heat shock transcription factor 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 492 амінокислот , а молекулярна маса — 53 011[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQEAPAALPT EPGPSPVPAF LGKLWALVGD PGTDHLIRWS PSGTSFLVSD
QSRFAKEVLP QYFKHSNMAS FVRQLNMYGF RKVVSIEQGG LLRPERDHVE
FQHPSFVRGR EQLLERVRRK VPALRGDDGR WRPEDLGRLL GEVQALRGVQ
ESTEARLREL RQQNEILWRE VVTLRQSHGQ QHRVIGKLIQ CLFGPLQAGP
SNAGGKRKLS LMLDEGSSCP TPAKFNTCPL PGALLQDPYF IQSPLPETNL
GLSPHRARGP IISDIPEDSP SPEGTRLSPS SDGRREKGLA LLKEEPASPG
GDGEAGLALA PNECDFCVTA PPPLPVAVVQ AILEGKGSFS PEGPRNAQQP
EPGDPREIPD RGPLGLESGD RSPESLLPPM LLQPPQESVE PAGPLDVLGP
SLQGREWTLM DLDMELSLMQ PLVPERGEPE LAVKGLNSPS PGKDPTLGAP
LLLDVQAALG GPALGLPGAL TIYSTPESRT ASYLGPEASP SP
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес , транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші