Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXA10
Ідентифікатори
Символи
HOXA10 , HOX1, HOX1.8, HOX1H, PL, Homeobox A10
Зовнішні ІД
OMIM : 142957 MGI: 96171 HomoloGene: 7365 GeneCards: HOXA10
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• skeletal system development • proximal/distal pattern formation • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • single fertilization • uterus development • multicellular organism development • embryonic limb morphogenesis • Сперматогенез • регуляція експресії генів • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 27.17 – 27.18 Mb
Хр. 6: 52.21 – 52.22 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HOXA10 (англ. Homeobox A10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот , а молекулярна маса — 42 414[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSARKGYLLP SPNYPTTMSC SESPAANSFL VDSLISSGRG EAGGGGGGAG
GGGGGGYYAH GGVYLPPAAD LPYGLQSCGL FPTLGGKRNE AASPGSGGGG
GGLGPGAHGY GPSPIDLWLD APRSCRMEPP DGPPPPPQQQ PPPPPQPPQP
APQATSCSFA QNIKEESSYC LYDSADKCPK VSATAAELAP FPRGPPPDGC
ALGTSSGVPV PGYFRLSQAY GTAKGYGSGG GGAQQLGAGP FPAQPPGRGF
DLPPALASGS ADAARKERAL DSPPPPTLAC GSGGGSQGDE EAHASSSAAE
ELSPAPSESS KASPEKDSLG NSKGENAANW LTAKSGRKKR CPYTKHQTLE
LEKEFLFNMY LTRERRLEIS RSVHLTDRQV KIWFQNRRMK LKKMNRENRI
RELTANFNFS
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Castronovo V., Kusaka M., Chariot A., Gielen J., Sobel M. (1994). Homeobox genes: potential candidates for the transcriptional control of the transformed and invasive phenotype. Biochem. Pharmacol. 47 : 137—143. PMID 7906121 DOI :10.1016/0006-2952(94)90447-2
Bae N.S., Swanson M.J., Vassilev A., Howard B.H. (2004). Human histone deacetylase SIRT2 interacts with the homeobox transcription factor HOXA10. J. Biochem . 135 : 695—700. PMID 15213244 DOI :10.1093/jb/mvh084
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші