ATF6

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ATF6
Ідентифікатори
Символи ATF6, ATF6A, ACHM7, activating transcription factor 6
Зовнішні ІД OMIM: 605537 MGI: 1926157 HomoloGene: 32015 GeneCards: ATF6
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Паркінсона, achromatopsia 7, achromatopsia[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_007348
NM_001081304
RefSeq (білок)
NP_031374
NP_001074773
Локус (UCSC) Хр. 1: 161.77 – 161.98 Mb Хр. 1: 170.53 – 170.7 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ATF6 (англ. Activating transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 670 амінокислот, а молекулярна маса — 74 585[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAAN
ETYENNFDNLDFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSY
SVSSPRSVDSYSSTQHVPEELDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKE
DKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQPKPLLLPAAPKTQTNSSVPA
KTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTVVQLQAPGVLP
SAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKK
ENGTLKRQLDEVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQ
DSRRMNPSVSPANQRRHLLGFSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKA
LMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRM
TNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPR
SYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFG
SPPAATEATHVVSTIPESLQ

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Zhu C., Johansen F.E., Prywes R. (1997). Interaction of ATF6 and serum response factor. Mol. Cell. Biol. 17: 4957—4966. PMID 9271374 DOI:10.1128/MCB.17.9.4957
  • Yoshida H., Haze K., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1998). Identification of the cis-acting endoplasmic reticulum stress response element responsible for transcriptional induction of mammalian glucose-regulated proteins; involvement of basic-leucine zipper transcription factors. J. Biol. Chem. 273: 33741—33749. PMID 9837962 DOI:10.1074/jbc.273.50.33741
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
  • Haze K., Yoshida H., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1999). Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol. Biol. Cell. 10: 3787—3799. PMID 10564271 DOI:10.1091/mbc.10.11.3787
  • Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. (2001). XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor. Cell. 107: 881—891. PMID 11779464 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00611-0

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з ATF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:791 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, P18850 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]