Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HSF2
Ідентифікатори
Символи
HSF2 , HSF 2, HSTF 2, heat shock transcription factor 2
Зовнішні ІД
OMIM : 140581 MGI: 96239 HomoloGene: 37931 GeneCards: HSF2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to heat • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 122.4 – 122.43 Mb
Хр. 10: 57.36 – 57.39 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HSF2 (англ. Heat shock transcription factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот , а молекулярна маса — 60 348[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKQSSNVPAF LSKLWTLVEE THTNEFITWS QNGQSFLVLD EQRFAKEILP
KYFKHNNMAS FVRQLNMYGF RKVVHIDSGI VKQERDGPVE FQHPYFKQGQ
DDLLENIKRK VSSSKPEENK IRQEDLTKII SSAQKVQIKQ ETIESRLSEL
KSENESLWKE VSELRAKHAQ QQQVIRKIVQ FIVTLVQNNQ LVSLKRKRPL
LLNTNGAQKK NLFQHIVKEP TDNHHHKVPH SRTEGLKPRE RISDDIIIYD
VTDDNADEEN IPVIPETNED VISDPSNCSQ YPDIVIVEDD NEDEYAPVIQ
SGEQNEPARE SLSSGSDGSS PLMSSAVQLN GSSSLTSEDP VTMMDSILND
NINLLGKVEL LDYLDSIDCS LEDFQAMLSG RQFSIDPDLL VDLFTSSVQM
NPTDYINNTK SENKGLETTK NNVVQPVSEE GRKSKSKPDK QLIQYTAFPL
LAFLDGNPAS SVEQASTTAS SEVLSSVDKP IEVDELLDSS LDPEPTQSKL
VRLEPLTEAE ASEATLFYLC ELAPAPLDSD MPLLDS
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес , транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Schuetz T.J., Gallo G.J., Sheldon L., Tempst P., Kingston R.E. (1991). Isolation of a cDNA for HSF2: evidence for two heat shock factor genes in humans. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 88 : 6911—6915. PMID 1871106 DOI :10.1073/pnas.88.16.6911
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Sheldon L., Kingston R.E. (1993). Hydrophobic coiled-coil domains regulate the subcellular localization of human heat shock factor 2 . Genes Dev . 7 : 1549—1558. PMID 8339932 DOI :10.1101/gad.7.8.1549
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші