CDH1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CDH1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1, E-cadherin, uvomorulin
Зовнішні ІД OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome, hereditary diffuse gastric cancer[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_004360
NM_001317184
NM_001317185
NM_001317186
NM_009864
RefSeq (білок)
NP_001304113
NP_001304114
NP_001304115
NP_004351
NP_033994
Локус (UCSC) Хр. 16: 68.74 – 68.84 Mb Хр. 8: 107.33 – 107.4 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGR
VLGRVNFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLV
YAWDSTYRKFSTKVTLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLR
RQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTP
PVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILI
TVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADL
QGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTD
ADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQY
ILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFG
VGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDR
EDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESI
ILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQP
VEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRD
NVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPR
PANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNS
SESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

[ред. | ред. код]
  • Bussemakers M.J.G., Mees S.G.M., van Bokhoven A., Debruyne F.M.J., Schalken J.A. (1993). Molecular cloning and characterization of the human E-cadherin cDNA. Mol. Biol. Rep. 17: 123—128. PMID 8459805 DOI:10.1007/BF00996219
  • Rimm D.L., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning of human E-cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 1754—1761. PMID 8185635 DOI:10.1006/bbrc.1994.1656
  • Bussemakers M.J.G., Giroldi L.A., van Bokhoven A., Schalken J.A. (1994). Transcriptional regulation of the human E-cadherin gene in human prostate cancer cell lines: characterization of the human E-cadherin gene promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1284—1290. PMID 8093045 DOI:10.1006/bbrc.1994.2321
  • Mansouri A., Spurr N., Goodfellow P.N., Kemler R. (1988). Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin. Differentiation. 38: 67—71. PMID 3263290 DOI:10.1111/j.1432-0436.1988.tb00593.x
  • Ozawa M., Ringwald M., Kemler R. (1990). Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4246—4250. PMID 2349235 DOI:10.1073/pnas.87.11.4246
  • Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion. FEBS Lett. 355: 195—200. PMID 7982500 DOI:10.1016/0014-5793(94)01205-9

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P12830 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]