DCP1B

DCP1B
Ідентифікатори
Символи	DCP1B, DCP1, hDcp1b, decapping mRNA 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 609843 MGI: 2442404 HomoloGene: 51881 GeneCards: DCP1B
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0010576 enzyme regulator activity • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • hydrolase activity Клітинна компонента • P-body • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	196513	319618
Ensembl	ENSG00000151065 ENSG00000284850	ENSMUSG00000041477
UniProt	Q8IZD4	B9EIX0
RefSeq (мРНК)	NM_152640 NM_001319292	NM_001033379
RefSeq (білок)	NP_001306221 NP_689853	NP_001028551
Локус (UCSC)	Хр. 12: 1.95 – 2 Mb	Хр. 6: 119.18 – 119.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCP1B (англ. Decapping mRNA 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 67 723.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVAAGGLV		GKGRDISLAA		LQRHDPYINR		IVDVASQVAL		YTFGHRANEW
EKTDVEGTLF		VYTRSASPKH		GFTIMNRLSM		ENRTEPITKD		LDFQLQDPFL
LYRNARLSIY		GIWFYDKEEC		QRIAELMKNL		TQYEQLKAHQ		GTGAGISPVI
LNSGEGKEVD		ILRMLIKAKD		EYTKCKTCSE		PKKITSSSAI		YDNPNLIKPI
PVKPSENQQQ		RIPQPNQTLD		PEPQHLSLTA		LFGKQDKATC		QETVEPPQTL
HQQQQQQQQQ		QEKLPIRQGV		VRSLSYEEPR		RHSPPIEKQL		CPAIQKLMVR
SADLHPLSEL		PENRPCENGS		THSAGEFFTG		PVQPGSPHNI		GTSRGVQNAS
RTQNLFEKLQ		STPGAANKCD		PSTPAPASSA		ALNRSRAPTS		VTPVAPGKGL
AQPPQAYFNG		SLPPQTVGHQ		AHGREQSTLP		RQTLPISGSQ		TGSSGVISPQ
ELLKKLQIVQ		QEQQLHASNR		PALAAKFPVL		AQSSGTGKPL		ESWINKTPNT
EQQTPLFQVI		SPQRIPATAA		PSLLMSPMVF		AQPTSVPPKE		RESGLLPVGG
QEPPAAATSL		LLPIQSPEPS		VITSSPLTKL		QLQEALLYLI		QNDDNFLNII
YEAYLFSMTQ		AAMKKTM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lykke-Andersen J. (2002). Identification of a human decapping complex associated with hUpf proteins in nonsense-mediated decay. Mol. Cell. Biol. 22: 8114—8121. PMID 12417715 DOI:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cougot N., Babajko S., Seraphin B. (2004). Cytoplasmic foci are sites of mRNA decay in human cells. J. Cell Biol. 165: 31—40. PMID 15067023 DOI:10.1083/jcb.200309008

Див. також

• Хромосома 12